一个女人从巫婆那儿得到了一颗神奇的种子，种子开出的花里坐着一个拇指那么大的小女孩，这个小女孩被取名为拇指姑娘。一只癞蛤蟆捉住了拇指姑娘，把她关在在高高的荷花上，一群金鱼合力救了拇指姑娘，拇指姑娘开始了一段奇妙的旅程。